はじめまして。
書き込みありがとうございます。
中3のお子さんの高校進学に関するお悩みですね。
3月に新居にご転居をするために東京に引っ越すとのことですが、中高一貫校の高校に進学したとしたらそれは通える距離なのでしょうか。
学校に行かなくなった原因のひとつにいじめがあるのであれば、まずはそれを解決しないとお子さんはいじめのグループが進学する高校には行きたいとは思わないのではないでしょうか。
学校は命を削ってまで通う場所ではありません。
帰国子女を多く受け入れている学校への転校等も選択肢のひとつに加えてみてはいかがですか。
また昼夜逆転に関しては対処法を以下にまとめましたので参考にしてください。